Ponedeljek, 11. avgust 2014. - Mednarodna preiskava s špansko udeležbo odkriva mehanizem, s katerim se na pljučih in kolorektalnih tumorjih uvede na stotine mutacij.
Transdukcija zaporedij v DNK je malo znan pojav in se mu zdi redek. Njen glavni protagonist je 50% genoma, imenovanega parazitska DNK, ki ga tvorijo elementi, ki se občasno razmnožujejo in selijo na druga mesta v genskem zaporedju.
"Opazili smo, da je specifična transdukcija sekvenc, povezana z genomom LINE-1, precej pogosta, zlasti pri genoma raka pljuč in debelega črevesa, " pravi José Tubío, raziskovalec na Institutu Wellcome Trust Sanger Cambridge in prvi podpisnik članka, ki je objavljen v reviji Science.
Skupaj z njim in kot del velike mednarodne skupine raziskovalcev so pri delu sodelovali še štirje španski znanstveniki v Cambridgeu: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora in Pablo Román.
Da bi dosegli ta sklep, so raziskovalci razvili algoritem, ki prepozna in ugotovi izvor in nove lokacije mobilnih elementov LINE-1.
"Spoznanje, kateri prenosni elementi našega genoma imajo aktivnost pri tumorjih in kje se skrivajo, odpira vrata zasnovi zdravil, ki utišajo mutageno aktivnost teh 74 elementov pri raku, ne da bi pri tem potrebovali uporabo širokospektralnih zdravil, ki lahko vplivajo na druge. regije genoma, "pravi Román, eden od soavtorjev dela in trenutno raziskovalec na HUCA za kostni in mineralni metabolizem.
Po drugi strani smo "ugotovili, da je prišlo do epigenetskih sprememb, povezanih s selitvijo prenosnih elementov. Glede na to, da so epigenetske spremembe tesno povezane z okoljem, to delo kaže na nov način odnosa med genomom in načinom prehranjevanja in dihanja.", pravi Roman.
Po Tubiovih besedah "bo treba opraviti več raziskav, da bomo odgovorili na vprašanja, ki jih postavlja ta raziskava o funkcionalnih posledicah mehanizma, ki smo jih opazili, vendar ni dvoma, da ta ugotovitev ponuja novo perspektivo, ki je zanimiva za diagnozo in zdravljenje. zdravnik raka. "
Vir:
Oznake:
Slovarček Preveri Prehrana-In-Prehrana
Transdukcija zaporedij v DNK je malo znan pojav in se mu zdi redek. Njen glavni protagonist je 50% genoma, imenovanega parazitska DNK, ki ga tvorijo elementi, ki se občasno razmnožujejo in selijo na druga mesta v genskem zaporedju.
"Opazili smo, da je specifična transdukcija sekvenc, povezana z genomom LINE-1, precej pogosta, zlasti pri genoma raka pljuč in debelega črevesa, " pravi José Tubío, raziskovalec na Institutu Wellcome Trust Sanger Cambridge in prvi podpisnik članka, ki je objavljen v reviji Science.
Skupaj z njim in kot del velike mednarodne skupine raziskovalcev so pri delu sodelovali še štirje španski znanstveniki v Cambridgeu: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora in Pablo Román.
Lokacija najbolj aktivnih elementov
Raziskovalci so analizirali mobilnost elementov LINE-1 v 300 genomov 12 različnih vrst raka in opazili, da se le 74 od 500.000 prenosnih elementov tipa LINE-1, ki so prisotni v človeški DNK, lahko giblje v rakavih genomih .Da bi dosegli ta sklep, so raziskovalci razvili algoritem, ki prepozna in ugotovi izvor in nove lokacije mobilnih elementov LINE-1.
"Spoznanje, kateri prenosni elementi našega genoma imajo aktivnost pri tumorjih in kje se skrivajo, odpira vrata zasnovi zdravil, ki utišajo mutageno aktivnost teh 74 elementov pri raku, ne da bi pri tem potrebovali uporabo širokospektralnih zdravil, ki lahko vplivajo na druge. regije genoma, "pravi Román, eden od soavtorjev dela in trenutno raziskovalec na HUCA za kostni in mineralni metabolizem.
Mobilizacija popolnih genov
Kot so ugotovili raziskovalci, transdukcija zaporedja, ki izhaja iz aktivnosti elementov LINE-1, včasih vključuje mobilizacijo celotnih genov in njihov prenos v druga področja DNA. Zato se spremeni struktura, število genov in izražanje genoma.Po drugi strani smo "ugotovili, da je prišlo do epigenetskih sprememb, povezanih s selitvijo prenosnih elementov. Glede na to, da so epigenetske spremembe tesno povezane z okoljem, to delo kaže na nov način odnosa med genomom in načinom prehranjevanja in dihanja.", pravi Roman.
Po Tubiovih besedah "bo treba opraviti več raziskav, da bomo odgovorili na vprašanja, ki jih postavlja ta raziskava o funkcionalnih posledicah mehanizma, ki smo jih opazili, vendar ni dvoma, da ta ugotovitev ponuja novo perspektivo, ki je zanimiva za diagnozo in zdravljenje. zdravnik raka. "
Vir:
